De dagelijkse leiding van het Geert Groote College is in handen van rector Coralie Pluut. Daarnaast zijn er per jaarlaag teamleiders aangesteld.
Het managementteam bestaat uit
Rector: Coralie Pluut
Conrector onderwijs: Fieke Otto-Ossenkoppele
Teamleider klas 7 t/m 10 vmbo-t/mavo: Buddy Salomonson
Teamleider klas 7 en 8 havo: Roos van Genderen
Teamleider klas 9 en 10 havo, Ithaka en vwo: Michiel Suurmond
Teamleider klas 10 en 11 havo, 11 en 12 Ithaka en vwo: Mark Sorée